Понятия «армия» и «реформа» сложно уживаются между собой. Поэтому, вероятно, так вяло проходит структурная перестройка ЗАТО. Поддерживать в них закрытый режим сложнее с каждым годом: нехватка средств на охрану и для ремонта заграждений, сокращение призывных ресурсов у армии. Минобороны было бы легче сбросить хотя бы часть подчинённых ЗАТО со своего баланса, не заниматься их снабжением и благоустройством, передать их гражданской администрации. Но население этих территорий, привыкшее к заботе и охране, выступает против этого. Не смотря на это, уже сейчас понятно, что некоторым из числа ЗАТО придется распрощаться со своим статусом. В числе кандидатов на это чаще всего фигурируют образования: Островной Мурманской области и поселок Озерный близ Бологого. Последний в силу своего расположения в комфортных природных условиях и непосредственной близости от магистралей имеет потенциал для развития в качестве гражданского поселения. А вот уход военных из заполярного Островного будет означать для города гибель.

Чуть более оптимистичны перспективы ЗАТО ведомства Минатома. Высокий технологический и научный уровень этих центров, присутствие исследовательских лабораторий и учреждений образования позволит создать на их базе технопарки японского или американского образца. Здесь можно будет развивать такие наукоемкие отрасли, как микроэлектроника, программирование и биотехнологии. Но проблема в том, что для их перепрофилирования также требуются немалые средства. У государства они найдутся вряд ли, а независимый инвестор, едва ли пойдет в закрытый город.