Первые ЗАТО были созданы в СССР еще в конце 1930-х гг., но руководство государства осознало реальную необходимость закрытых городов, военно-морских баз, полигонов и ракетных частей только после Великой Отечественной.

И такие образования постепенно начали строиться по всему Союзу. При этом отдельная история была с городами атомного производства.

У советской разведки имелись сведениями о разрабатывающейся на Западе атомной бомбе, и Берия сообщал об этом Сталину. Впрочем, по некоторым источникам, доходчиво объяснить вождю необходимость «царь-бомбы» удалось только физику Флёрову, после чего в феврале 1943 г. было принято постановление о начале работы по её созданию. В большой степени, ускорили этот процесс испытания своей бомбы американцами на японских Хиросиме и Нагасаки в 45-ом. После этих событий Сталиным было приказано создавать целый ряд «закрыток», которые будут разрабатывать, испытывать и в итоге создадут атомную бомбу, притом по-мощнее американской.

Так и родились 10 атомных городов. Сегодня они носят названия: Саров, Новоуральск, Заречный, Лесной, Озёрск, Снежинск, Трехгорный, Железногорск, Зеленогорск и Северск), и по-прежнему имеют статус высокой секретности.

Строительство «запреток» было поручено НКВД и лично Лаврентию Берии, в связи с этим не вызывает удивления тот факт, что многие ЗАТО строили заключенные сталинского ГУЛАГа, а после строительства часть из них была расстреляна, прямо в товарных вагонах, куда их сажали под предлогом этапирования на очередное строительство.